Основные задачи отдела:

1. планирование и исполнение мероприятий утвержденных программ (подпрограмм) по развитию информатизации в сфере здравоохранения автономного округа;

2. создание, развитие и содержание вычислительной инфраструктуры здравоохранения автономного округа;

3. выработка предложений по повышению эффективности деятельности учреждений здравоохранения автономного округа в сфере информатизации;

4. техническое обеспечение деятельности департамента здравоохранения автономного округа в сфере информационных технологий;

5. взаимодействие со сторонними организациями по вопросам использования информационных технологий в сфере здравоохранения на территории автономного округа.